Update measurement data in lesion table
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9fb5cc2953
@ -17,7 +17,6 @@ var cornerstoneTools = (function ($, cornerstone, cornerstoneMath, cornerstoneTo
|
||||
var element = mouseEventData.element;
|
||||
timepointID = getActiveTimepointID(element);
|
||||
var lesionNumber = measurementManagerDAL.getLesionNumber(timepointID);
|
||||
console.log(lesionNumber);
|
||||
var lesionCounter = "";
|
||||
|
||||
// Subscribe CornerstoneMouseup event, when mouse is up, call lesionDialog
|
||||
@ -137,82 +136,14 @@ var cornerstoneTools = (function ($, cornerstone, cornerstoneMath, cornerstoneTo
|
||||
function updateLesionCollection(lesionData, currentElement) {
|
||||
|
||||
if (lesionData.active) {
|
||||
activeLesionMeasurementData = lesionData;
|
||||
if(lesionData.timepointID != undefined && lesionData.timepointID != "") {
|
||||
// Update Measurements Collection
|
||||
measurementManagerDAL.updateTimepointData(lesionData);
|
||||
|
||||
} else {
|
||||
activeLesionMeasurementData = lesionData;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
// TODO: Option1: Create a global variable like lesionMeasurementData
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||||
// TODO: Insert lesionData inside the lesionMeasurementData
|
||||
// TODO: Send the lesionMeasurementData to lesionDialog by ShowLesionDialog event
|
||||
|
||||
/*if (lesionMeasurementData != undefined && lesionMeasurementData.lesionNumber === lesionData.index) {
|
||||
lesionMeasurementData.timepoints.now.longestDiameter = lesionData.measurementText;
|
||||
console.log(lesionMeasurementData.timepoints.now.longestDiameter);
|
||||
} else {
|
||||
lesionMeasurementData = {
|
||||
lesionNumber: lesionData.index,
|
||||
isTarget: true,
|
||||
location: '',
|
||||
timepoints: {
|
||||
"now": {
|
||||
imageId: "blah",
|
||||
timepointUid: "timepointX",
|
||||
date: 2010,
|
||||
isDirty: true,
|
||||
longestDiameter: lesionData.measurementText
|
||||
},
|
||||
"earlier": {
|
||||
imageId: "blah2",
|
||||
timepointUid: "timepointy",
|
||||
date: 2010,
|
||||
isDirty: true,
|
||||
longestDiameter: 8
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
};
|
||||
}*/
|
||||
|
||||
// TODO: Option2:
|
||||
// Check collection has this lesionData
|
||||
/*var isFound = Measurements.findOne({lesionNumber: lesionData.index});
|
||||
|
||||
// TODO: Decide which time point is changed
|
||||
if (isFound) {
|
||||
// Update measurement text
|
||||
Measurements.update(
|
||||
{ lesionNumber: lesionData.index },
|
||||
{
|
||||
$set: {
|
||||
"timepoints.now.longestDiameter": lesionData.measurementText
|
||||
}
|
||||
}, {multi: true}
|
||||
);
|
||||
|
||||
console.log(Measurements.find());
|
||||
} else {
|
||||
var lesionObject = {
|
||||
lesionNumber: lesionData.index,
|
||||
isTarget: true,
|
||||
location: '',
|
||||
isHidden: true,
|
||||
timepoints: {
|
||||
"now": {
|
||||
imageId: "blah",
|
||||
timepointUid: "timepointX",
|
||||
date: 2010,
|
||||
isDirty: true,
|
||||
longestDiameter: lesionData.measurementText
|
||||
},
|
||||
"earlier": {
|
||||
imageId: "blah2",
|
||||
timepointUid: "timepointy",
|
||||
date: 2010,
|
||||
isDirty: true,
|
||||
longestDiameter: 8
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
};
|
||||
Measurements.insert(lesionObject);
|
||||
}*/
|
||||
}
|
||||
|
||||
function renderLesion(lesion, context, eventData){
|
||||
|
||||
@ -2,50 +2,6 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
var trialPatientLocations = [];
|
||||
var timepoints = [];
|
||||
|
||||
// timepointID = tabId + activeViewportIndex
|
||||
/*timepoints = [
|
||||
{
|
||||
timepointID: "tp0",
|
||||
rois: [
|
||||
{
|
||||
UID: "345",
|
||||
number: 1,
|
||||
measurement: "22.34",
|
||||
locationUID: 12345
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
UID: "245",
|
||||
number: 2,
|
||||
measurement: "22.34",
|
||||
locationUID: 1745
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
timepointID: "tp1",
|
||||
rois: [
|
||||
{
|
||||
UID: "243",
|
||||
number: 1,
|
||||
measurement: "22.34",
|
||||
locationUID: 12345
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
timepointID: "tp2",
|
||||
rois: [
|
||||
{
|
||||
UID: "253",
|
||||
number: 1,
|
||||
measurement: "0.34",
|
||||
locationUID: 12345
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
}
|
||||
];
|
||||
*/
|
||||
|
||||
// Returns trialPatientLocations array
|
||||
function getPatientLocations () {
|
||||
return trialPatientLocations;
|
||||
@ -76,13 +32,6 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
return locationUID;
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
// Insert Measurements Collection
|
||||
function insertDataToMeasurementCollection (lesionData) {
|
||||
|
||||
|
||||
}
|
||||
|
||||
function getContentId () {
|
||||
return Session.get("activeContentId");
|
||||
}
|
||||
@ -93,9 +42,43 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
return tabData[0].timepoints;
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Adds new timepoint item to tiemepoints array
|
||||
function addLesionData (lesionData) {
|
||||
// Add timepoint data to Measurements collection
|
||||
function addTimepointData(lesionData) {
|
||||
|
||||
var contentId = getContentId();
|
||||
var timepointsOfTab = getTimepointsOfTab();
|
||||
var timepointsArr = [];
|
||||
for(var i=0; i< timepointsOfTab.length; i++) {
|
||||
var timepointId = timepointsOfTab[i].timepointID;
|
||||
var lesionTimepointId = lesionData.timepointID;
|
||||
|
||||
if (timepointId === lesionTimepointId) {
|
||||
// Add real mesurement
|
||||
var timepointObject = {};
|
||||
timepointObject[timepointId] = {longestDiameter: lesionData.measurementText};
|
||||
timepointsArr.push(timepointObject);
|
||||
} else {
|
||||
// Add null measurement
|
||||
var timepointObject = {};
|
||||
timepointObject[timepointId] = {longestDiameter: ""};
|
||||
timepointsArr.push(timepointObject);
|
||||
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
var lesionDataCollectionObject = {
|
||||
lesionNumber: lesionData.lesionNumber,
|
||||
isTarget: true,
|
||||
locationUID: lesionData.locationUID,
|
||||
location: getLocationName(lesionData.locationUID),
|
||||
timepoints: timepointsArr
|
||||
};
|
||||
|
||||
Measurements.insert({contentId: contentId, lesionData: lesionDataCollectionObject});
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Update timepoint data in Measurements collection
|
||||
function updateTimepointData (lesionData) {
|
||||
var contentId = getContentId();
|
||||
var timepointID = lesionData.timepointID;
|
||||
var tabMeasurements = Measurements.find({contentId: contentId, "lesionData.lesionNumber": lesionData.lesionNumber}).fetch();
|
||||
@ -119,39 +102,31 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
}, {multi: true}
|
||||
);
|
||||
|
||||
} else {
|
||||
|
||||
// Add new measurement data
|
||||
var timepointsOfTab = getTimepointsOfTab();
|
||||
var timepointsArr = [];
|
||||
for(var i=0; i< timepointsOfTab.length; i++) {
|
||||
var timepointId = timepointsOfTab[i].timepointID;
|
||||
var lesionTimepointId = lesionData.timepointID;
|
||||
|
||||
if (timepointId === lesionTimepointId) {
|
||||
// Add real mesurement
|
||||
var timepointObject = {};
|
||||
timepointObject[timepointId] = {longestDiameter: lesionData.measurementText};
|
||||
timepointsArr.push(timepointObject);
|
||||
} else {
|
||||
// Add null measurement
|
||||
var timepointObject = {};
|
||||
timepointObject[timepointId] = {longestDiameter: ""};
|
||||
timepointsArr.push(timepointObject);
|
||||
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
var lesionDataCollectionObject = {
|
||||
lesionNumber: lesionData.lesionNumber,
|
||||
isTarget: true,
|
||||
location: getLocationName(lesionData.locationUID),
|
||||
timepoints: timepointsArr
|
||||
};
|
||||
|
||||
Measurements.insert({contentId: contentId, lesionData: lesionDataCollectionObject});
|
||||
}
|
||||
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Check timepointData is found in Measurements collection
|
||||
function timepointDataIsFound (lesionNumber) {
|
||||
var contentId = getContentId();
|
||||
var timepointData = Measurements.findOne({contentId: contentId, "lesionData.lesionNumber": lesionNumber});
|
||||
if (timepointData != undefined) {
|
||||
return true;
|
||||
} else {
|
||||
return false;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Adds new timepoint item to tiemepoints array
|
||||
function addLesionData (lesionData) {
|
||||
if(timepointDataIsFound(lesionData)) {
|
||||
// Update data
|
||||
updateTimepointData(lesionData);
|
||||
} else{
|
||||
// Insert data
|
||||
addTimepointData(lesionData);
|
||||
}
|
||||
|
||||
// TODO: This code block will be removed
|
||||
// Populate timepoints array
|
||||
var roi = {
|
||||
uid: lesionData.uid,
|
||||
@ -169,47 +144,48 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
timepoints.push({timepointID: timepointID, rois: [roi]});
|
||||
}
|
||||
|
||||
insertDataToMeasurementCollection(lesionData);
|
||||
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Returns new lesion number according to timepointID
|
||||
function getNewLesionNumber (timepointID) {
|
||||
// Check timepoint is in timepoints array
|
||||
for (var i=0; i< timepoints.length; i++) {
|
||||
var timepoint = timepoints[i];
|
||||
if(timepoint.timepointID === timepointID) {
|
||||
return timepoint.rois.length + 1;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
var contentId = getContentId();
|
||||
var lesionNumberCounter = 0;
|
||||
var timepointsData = Measurements.find({contentId: contentId}).fetch();
|
||||
if(timepointsData.length > 0) {
|
||||
for(var i=0; i< timepointsData.length; i++) {
|
||||
var timepointData = timepointsData[i];
|
||||
var timepoints = timepointData.lesionData.timepoints;
|
||||
for(var j=0; j< timepoints.length; j++) {
|
||||
var timepoint = timepoints[j];
|
||||
var key = Object.keys(timepoint);
|
||||
if(key == timepointID) {
|
||||
if (timepoint[key].longestDiameter === "") {
|
||||
return timepointData.lesionData.lesionNumber;
|
||||
|
||||
// Add new time point
|
||||
timepoints.push({timepointID: timepointID, rois: []});
|
||||
} else {
|
||||
lesionNumberCounter = lesionNumberCounter + 1;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
console.log(lesionNumberCounter + 1);
|
||||
|
||||
return lesionNumberCounter + 1;
|
||||
}
|
||||
|
||||
return 1;
|
||||
}
|
||||
|
||||
// If lesion number is added for any timepoint, returns lesion locationUID
|
||||
function isLesionNumberAdded (lesionNumber) {
|
||||
if (timepointDataIsFound(lesionNumber)){
|
||||
var contentId = getContentId();
|
||||
var timepointData = Measurements.find({contentId: contentId, "lesionData.lesionNumber": lesionNumber}).fetch();
|
||||
return timepointData[0].lesionData.locationUID;
|
||||
|
||||
for (var i=0; i< timepoints.length; i++) {
|
||||
var timepoint = timepoints[i];
|
||||
var rois = timepoint.rois;
|
||||
|
||||
for(var j=0; j<rois.length; j++) {
|
||||
var roi = rois[j];
|
||||
if (roi.number === lesionNumber) {
|
||||
return roi.locationUID;
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
return null
|
||||
|
||||
return null;
|
||||
}
|
||||
|
||||
// Adds lesion data to Measurements collection
|
||||
function addLesionToMeasurementsCollection (lesionData){
|
||||
Measurements.insert(lesionData);
|
||||
}
|
||||
|
||||
return {
|
||||
@ -218,7 +194,8 @@ var measurementManagerDAL = (function () {
|
||||
addLesionData: addLesionData,
|
||||
getLesionNumber: getNewLesionNumber,
|
||||
isLesionNumberAdded: isLesionNumberAdded,
|
||||
getTimepoints: getTimepoints
|
||||
getTimepoints: getTimepoints,
|
||||
updateTimepointData: updateTimepointData
|
||||
|
||||
};
|
||||
})();
|
||||
@ -7,7 +7,7 @@ Template.lesionDialog.onRendered(function () {
|
||||
if(locationUID != null) {
|
||||
|
||||
activeLesionMeasurementData.locationUID = locationUID;
|
||||
measurementManagerDAL.addLesionData(activeLesionMeasurementData);
|
||||
measurementManagerDAL.updateTimepointData(activeLesionMeasurementData);
|
||||
}else{
|
||||
|
||||
// Show Dialog
|
||||
@ -23,36 +23,3 @@ Template.lesionDialog.onRendered(function () {
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
// Listen lesionMeaurementCreated Event and when this event is triggered, show lesionLocationDialog Box
|
||||
/*
|
||||
$(document).on("lesionMeasurementCreated",function(e,eventCaller,data){
|
||||
console.log("Lesion measurement xreated");
|
||||
var element = data.element;
|
||||
var tabId = data.tabId;
|
||||
var viewports = $("#content"+tabId).find(".imageViewerViewport");
|
||||
var viewportIndex = $(viewports).index($(element));
|
||||
data.viewportIndex = viewportIndex;
|
||||
data.totalViewportCount = viewports.length;
|
||||
|
||||
//Set Lesion Table Data to insert into lesion table
|
||||
setLesionTableData(data);
|
||||
|
||||
// Check popup will shown or not
|
||||
var returnVal = lesionNumberIsAdded(data);
|
||||
if(!returnVal.isFound) {
|
||||
if( !Session.get("lesionLocationSelected") ) {
|
||||
$("#modal-dialog-container").css({
|
||||
"top": eventCaller.pageY,
|
||||
"left": eventCaller.pageX
|
||||
});
|
||||
|
||||
$("#lesionDialog").modal("show");
|
||||
}
|
||||
} else {
|
||||
// If lesionNumber is added before:
|
||||
data.rowIndex = returnVal.rowIndex;
|
||||
$(document).trigger("addLesionToExistedRow",data);
|
||||
}
|
||||
});*/
|
||||
|
||||
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